به کارگیری تجزیه ماتریس در کاهش ابعاد داده نوع گراف:مورد کاوی داده ریزآرایه

چکیده به کارگیری تجزیه ماتریس در کاهش ابعاد داده نوع گراف: مورد کاوی داده ریز آرایه به کوشش: فهیمه گودرزی یکی از شاخه های مهم بیو انفوماتیک فناوری ریز آرایه dna است که امکان بررسی عبارت هزاران ژن را به طور هم زمان و در حداقل زمان ممکن می سازد که در سال های اخیر موجب تولید حجم انبوهی از داده های عبارت ژن شده است. تحلیل آماری این داده ها شامل نرمال سازی، خوشه بندی، طبقه بندی و ... غیره از جمله روش های مورد استفاده در تحلیل این نوع داده ها است. اما تکنیک های داده کاوی و یادگیری ماشین برای داده با ابعاد بالا موثر نمی باشند و دقت پرس و جو و بهره وری آن ها با افزایش ابعاد داده به سرعت تنزل می یابد. از اینرو در دهه اخیر با ظهور فناوری ریز آرایه، مرکز توجه جدیدی به مسائلی چون بازنمایی داده و کاهش ابعاد داده عبارت ژن معطوف گشته است و پژوهش های بسیاری بر روی بررسی تاثیر استفاده از تکنیک های کاهش ابعاد بر روی مدل های کاوش نظارت شده و یا بدون نظارت داده ریز آرایه انجام شده است. در این رساله روش کاهش ابعاد مبتنی بر تجزیه ماتریس غیر منفی ارایه می شود و عملکرد آن بر روی تجزیه و تحلیل خوشه بندی دو مجموعه داده leukemia و 9-tumors که کلاس نمونه ها در آن شناخته شده است، مورد بررسی قرار می گیرد. از نرم افزار matlab برای تحلیل داده ها استفاده می شود. با توجه به انطباق قابل توجه نتایج خوشه بندی با گروه بندی واقعی داده ها، که بر اساس عامل های کاهش یافته انجام می شود، می توان از این روش در خوشه بندی مواردی که اطلاع دقیقی از گروه بندی واقعی داده ها در دست نیست، استفاده کرد. کلمات کلیدی: بیو انفورماتیک، تجزیه ماتریس، کاهش ابعاد، ریز آرایه dna، داده عبارت ژن، خوشه بندی